完达山得天独厚的自然优势和严格的奶源管理模式为完达山生产优质乳品提供了强有力的保障。在生产管理上，完达山从原料验收到成品出厂有一整套完善的管理制度。为了在产品质量管理上与国际接轨，完达山乳业实施并通过了ISO9001质量管理体系认证，HACCP(危害分析及关键控制点—乳制品生产企业要求)食品安全管理体系认证，引进GMP乳制品企业良好生产规范，导入“6S”现场管理等国际先进的管理方法，实行严格的可追溯体系。通过实施食品安全管理体系, 保证了产品的营养和安全，做到有效地预防食品安全危害的发生。
完达山在设备上实现了自动化加工生产，包括自动配料、自动清洗等，对关键控制点及清洗、杀菌灯等关键参数进行授权管理，对设定的多维参数如供热、时间、物料变量等进行自动化全程监控。对比只能进行一维调整的在线监测，完达山实现了自动化程度在国内最高、在国际仍处于领先水平的精细化管理。
在检测上，完达山投资数近1.5亿元建立了现代化乳品检测中心和各分、子公司检验室。在产品标准方面，制定了优于国家标准的企业内部标准，原料及产品均实施“三级检测”制度，在加工环节上，采取 “原辅料——半成品——成品”检验制度，在加工过程中，每隔半小时就要对工序上的产品做一次抽检；在产品发往市场前，采取“分厂——分公司——中心化验室”三级检验制度，不合格的产品绝对不出厂；在成品进入物流库后、发往市场前，中心实验室还要对数十项指标等进行周密的检测，合格产品才可以进入市场。
完达山还建立了完善的记录和标识与电子可追溯性程序，成为建立婴幼儿配方奶粉全程质量可追溯系统的四家试点单位之一。完达山乳业对生产过程中的每个工序都进行详细的记录，以预处理工段为例，多达22个电子控制界面为产品的可追溯性提供了保障，每一批产品都可以追溯到所使用的原料奶产地、原材料、使用量、原辅料供应商、生产时间、生产过程工艺参数、生产班次、班上作业人员、成品检验人员、放行人员、每批产品物流存储地点、物流发货去向，从而实现对产品质量与食品安全的全过程监控和全方位追踪问效。
完达山产品问世近半个世纪以来，经国家质量技术监督局历年、历次抽检，合格率始终100%。
